方式一：Run项 和 RunOnce项
Run和RunOnce注册表项在用户每次登录时运行。键名随便写，键值为可执行文件的绝对路径，长度不能超过260个字符。如果在这两个启动项下有多个程序，则这些程序的运行顺序并不确定。
- Run项的值会一直存在，除非用户主动删除。RunOnce会在下一次重启时，运行指定键值的程序之前自动删除。也就是说，该键值下的程序只在下一次重启时启动一次，再重启不会运行。
- 如果在RunOnce的键名前加一个感叹号（ ! ），则表示该键是在程序运行后删除。如果键名前加一个星号（ * ），则表示该键值对应的程序在系统安全模式下也允许运行。
Windows注册表这两项包括以下四个键：
- HKEY_LOCAL_MACHINE\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Run
- HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Run
- HKEY_LOCAL_MACHINE\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\RunOnce
- HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\RunOnce
方式二：其他注册表启动项
Windows自启动方式有很多，包括并不限于启动菜单快捷方式、计划任务、注册表、组策略、服务等，本文仅针对注册表项讨论。以下方式未经测试，使用前请于不同版本系统中详测。
1. Load注册键
介绍该注册键的资料不多，实际上它也能够自动启动程序。位置：HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\WindowsNT\CurrentVersion\Windows\load。
2. Userinit注册键
位置：HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\WindowsNT\CurrentVersion\Winlogon\Userinit。这里也能够使系统启动时自动初始化程序。通常该注册键下面有一个userinit.exe，如图一，但这个键允许指定用逗号分隔的多个程序，例如“userinit.exe,OSA.exe”（不含引号）。
3. Explorer\Run注册键
与load、Userinit不同，Explorer\Run键在HKEY_CURRENT_USER和HKEY_LOCAL_MACHINE下都有，具体位置是：
- HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Policies\Explorer\Run
- HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Policies\Explorer\Run。
4. RunServicesOnce注册键
RunServicesOnce注册键用来启动服务程序，启动时间在用户登录之前，而且先于其他通过注册键启动的程序。RunServicesOnce注册键的位置是：
- HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\RunServicesOnce
- HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\RunServicesOnce
5. RunServices注册键
RunServices注册键指定的程序紧接RunServicesOnce指定的程序之后运行，但两者都在用户登录之前。RunServices的位置是：
- HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\RunServices
- HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\RunServices
6. RunOnce\Setup注册键
RunOnce\Setup指定了用户登录之后运行的程序，它的位置是：
- HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\RunOnce\Setup
- HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\RunOnce\Setup。
7. RunOnce注册键
安装程序通常用RunOnce键自动运行程序，它的位置在:
- HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\RunOnce
- HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\RunOnce
HKEY_LOCAL_MACHINE下面的RunOnce键会在用户登录之后立即运行程序，运行时机在其他Run键指定的程序之前。HKEY_CURRENT_USER下面的RunOnce键在操作系统处理其他Run键以及“启动”文件夹的内容之后运行。如果是XP，你还需要检查一下HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\RunOnceEx。
8. Run注册键
Run是自动运行程序最常用的注册键，位置在：
- HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Run
- HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Run
HKEY_CURRENT_USER下面的Run键紧接HKEY_LOCAL_MACHINE下面的Run键运行，但两者都在处理“启动”文件夹之前。
参考链接：
https://docs.microsoft.com/en-us/windows/win32/setupapi/run-and-runonce-registry-keys